MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Enterobacter cloacae EcWSU1 plasmid pEcWSU1_A

Total Repeats: 245

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016515	A	8	8	77	84	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016515	A	7	7	180	186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016515	TGT	2	6	230	235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016515	GGC	2	6	1277	1282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016515	GTT	2	6	1288	1293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016515	CCGC	2	8	1361	1368	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_016515	CAA	2	6	1578	1583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016515	CAC	2	6	1591	1596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_016515	TAC	2	6	1620	1625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016515	TAC	2	6	1663	1668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016515	CAGG	2	8	1778	1785	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016515	GA	3	6	1837	1842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016515	GT	3	6	1845	1850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016515	ATT	2	6	1867	1872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016515	ATT	2	6	2720	2725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016515	TTTA	2	8	2777	2784	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016515	ATC	2	6	3074	3079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016515	T	6	6	3101	3106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016515	TGT	2	6	3124	3129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016515	TGCA	2	8	3132	3139	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016515	TGT	2	6	3297	3302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016515	ACTTA	2	10	3429	3438	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_016515	ATC	2	6	3981	3986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016515	ATC	2	6	5821	5826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016515	TTA	2	6	5839	5844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016515	A	6	6	5852	5857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016515	GCC	2	6	5858	5863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_016515	CGG	2	6	5867	5872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016515	CAC	2	6	6341	6346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_016515	GCT	2	6	6354	6359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016515	GAC	2	6	6379	6384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016515	CCG	2	6	6451	6456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_016515	GCA	2	6	6473	6478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016515	CGA	2	6	6509	6514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016515	CGT	3	9	6560	6568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016515	TAT	2	6	6622	6627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016515	ACGCT	2	10	6634	6643	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_016515	CGA	2	6	6654	6659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016515	TTA	2	6	6665	6670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016515	ATT	2	6	6720	6725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016515	GATT	2	8	6748	6755	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016515	A	7	7	6860	6866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016515	TAA	2	6	6878	6883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016515	TA	3	6	6906	6911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016515	TTTTG	2	10	7575	7584	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016515	GCA	2	6	8425	8430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016515	ATC	2	6	8522	8527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016515	ATT	2	6	8590	8595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016515	TTA	2	6	8601	8606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016515	CT	3	6	8630	8635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016515	GC	3	6	8679	8684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016515	TCCGG	2	10	8694	8703	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_016515	GGT	2	6	9848	9853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016515	TACCA	2	10	9897	9906	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_016515	CGA	2	6	10883	10888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016515	TAC	2	6	10901	10906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016515	AG	4	8	14507	14514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016515	AGT	2	6	14517	14522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016515	CGC	2	6	14526	14531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_016515	GTT	2	6	14682	14687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016515	CCTC	2	8	14788	14795	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_016515	GGT	2	6	15723	15728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016515	CCTT	2	8	15780	15787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016515	ATA	2	6	17393	17398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016515	TTA	2	6	17417	17422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016515	TAA	2	6	17444	17449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016515	TTG	2	6	17454	17459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016515	TTA	2	6	17472	17477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016515	ATT	2	6	17528	17533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016515	T	6	6	17532	17537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016515	TAT	2	6	17545	17550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016515	TAA	2	6	17553	17558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016515	AACA	2	8	17562	17569	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016515	AAC	2	6	18521	18526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016515	AAC	2	6	18529	18534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016515	GTT	2	6	19450	19455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016515	GAT	2	6	20118	20123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016515	CTG	2	6	20124	20129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016515	GGC	2	6	20557	20562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016515	TCTG	2	8	20566	20573	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016515	ATT	2	6	20600	20605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016515	TGT	2	6	20612	20617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016515	ATG	2	6	20628	20633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016515	ATA	2	6	20634	20639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016515	AATTA	2	10	20659	20668	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016515	T	6	6	20696	20701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016515	ACG	2	6	20771	20776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016515	ACA	2	6	20799	20804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016515	AGA	2	6	20808	20813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016515	A	7	7	20941	20947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016515	ATT	2	6	20954	20959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016515	TAT	2	6	20970	20975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016515	TAG	2	6	20981	20986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016515	ATT	2	6	21001	21006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016515	AAG	2	6	21110	21115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016515	ACC	2	6	23733	23738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_016515	CATA	2	8	23816	23823	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_016515	TTC	2	6	24585	24590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016515	GAT	2	6	25529	25534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016515	GTA	2	6	25542	25547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016515	GGA	2	6	25608	25613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016515	GATT	2	8	25617	25624	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016515	TTG	2	6	25654	25659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016515	TAA	2	6	25661	25666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016515	ATT	2	6	25670	25675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016515	GAA	2	6	25685	25690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016515	ATA	2	6	25691	25696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016515	ATC	2	6	25722	25727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016515	CATC	2	8	25754	25761	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_016515	CTT	2	6	25841	25846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016515	AG	3	6	25884	25889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016515	CAG	2	6	25936	25941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016515	AAC	2	6	25988	25993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016515	CAG	2	6	26002	26007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016515	CAT	2	6	26011	26016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016515	AGC	2	6	26063	26068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016515	CTG	2	6	26510	26515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016515	CT	3	6	26539	26544	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016515	GAA	2	6	26622	26627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016515	T	8	8	26694	26701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016515	CAG	2	6	27154	27159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016515	T	6	6	27401	27406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016515	TGG	2	6	27413	27418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016515	TAC	2	6	27456	27461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016515	TGCGT	2	10	31856	31865	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_016515	TC	3	6	34712	34717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016515	CTGG	2	8	34897	34904	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_016515	GTA	2	6	35158	35163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016515	ACA	2	6	35165	35170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016515	GT	3	6	35180	35185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016515	GTTG	2	8	35199	35206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016515	TTA	2	6	35228	35233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016515	GAG	2	6	35251	35256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016515	AGA	2	6	35834	35839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016515	TTG	2	6	35870	35875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016515	A	6	6	36950	36955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016515	ATT	2	6	37994	37999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016515	ACA	3	9	38078	38086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_016515	T	6	6	39443	39448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016515	TC	3	6	39464	39469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_016515	CATA	2	8	39527	39534	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016515	ACCA	2	8	39910	39917	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_016515	T	9	9	39926	39934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016515	A	7	7	39938	39944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016515	ATC	2	6	39948	39953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_016515	GAA	2	6	39972	39977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016515	GAG	2	6	40029	40034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016515	AAGC	2	8	40099	40106	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_016515	ACAGG	2	10	40128	40137	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
150	NC_016515	TC	3	6	41551	41556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_016515	CA	3	6	41713	41718	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_016515	TAG	2	6	41788	41793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016515	TC	3	6	41887	41892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_016515	TGG	2	6	43032	43037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_016515	TTG	2	6	45713	45718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_016515	TGA	2	6	47398	47403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_016515	AC	3	6	47601	47606	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
169	NC_016515	ATT	2	6	47622	47627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_016515	CTT	2	6	47775	47780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_016515	ATG	2	6	48210	48215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_016515	CTTT	2	8	48310	48317	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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187	NC_016515	AT	3	6	48396	48401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_016515	TGA	2	6	49362	49367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
199	NC_016515	A	7	7	49371	49377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.